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专项实施管理办公室主任、国家卫生健康委员会科教司监察专员刘登峰表示，专项为有效应对近年来甲型H1N1流感、H7N9流感、中东呼吸道综合征、埃博拉等重大突发疫情发挥了重要支撑作用，实现了从被动应付疫情到主动应对威胁的转变。
刚刚过去的2017年冬季流感让人记忆犹新。在专项支持下，通过监测季节性流感流行强度和病毒变异情况，为我国2017年冬季的流感防控提供了科学依据。专项技术副总师、中国工程院院士徐建国认为，“我们虽然取得了很大的进步，但并没有认识到流感所有的问题，还有很多科学问题有待解答。”
“新型四价流感疫苗已申报审批，有望在今年上市。”徐建国表示，接下来将加强应急救治技术研究，不断提高突发流感重症病例临床救治能力。
专项技术副总师、中国工程院院士李兰娟带领团队，在专项支持下建立了新发传染病病原的早期快速识别体系，通过测序以及高通量分析等先进技术，对全国的传染病防治监控布局，并提出“四抗二平衡”疗法，创新了救治策略。
“在专项的支持下，我国流感疫苗研发的能力、水平大幅提升。一旦流感病毒有新的变异，我们能够主动研发流感疫苗，将主动权掌握在自己手中。”李兰娟说。
科技部国家科技重大专项作为实施创新驱动发展战略的重要抓手，瞄准重大战略需求，取得显著进展。科技部重大专项办公室副主任杨哲表示，传染病防治专项在组织实施过程中，产生了一大批重大标志性成果，在近年防控历次重大疫情中成功应对、主动出击，为科技惠民、改善民生提供了有力保障。
