作为“十二五”“重大新药创制”科技重大专项技术总师，桑国卫表示，“十二五”以来，该专项针对重大疾病，围绕产业链部署研发链，共获批24个1类新药，相当于近50年总数的5倍；建成各类平台近300个，突破核心关键技术50余项，获得国家一二等奖51项；支持产业创新孵化基地60余个；国家经费投入71.9亿元人民币，产生直接经济效益1600亿元人民币，出口产值37亿美元；生物疫苗研发水平位居世界前列，化学药物创新研究实现与国际同步，中药产业形成全球化发展趋势，促进了我国医药科技由仿制向创新、医药产业由大国向强国迈进。
前不久，“重大新药创制”科技重大专项“十三五”总体组名单出炉，桑国卫继续担任该专项“十三五”技术总师。他透露：“十三五”“重大新药创制”科技重大专项，将围绕一条主线(产品技术)、两个维度(战略需求、民生现实需求)、三种能力(自主创新、转化应用、国际竞争)的发展思路实施。在具体谈到2017年的课题立项考虑时，桑国卫表示，将安排“十三五”60%以上的任务量，采取自下而上和自上而下相结合的组织方式，以提高目标性、集成度，定向委托和定向择优为主，以公开择优和后补助为补充，严格控制课题数量。
“十三五”该专项定向委托课题包括：“药物一致性评价技术与标准研究”，由中国食品药品检定研究院牵头，联合国家食品药品监管总局药品审评中心和科研院所、企业来完成；“青蒿素及其衍生物创新药物研究”，由中国中医科学院牵头，联合相关高校和企业等完成。定向择优课题则包括：天然药物来源创新药物新品种研发及其关键创新技术体系、新靶点小分子药物新品种研发及其关键创新技术体系、应急医学药物新品种研发及其关键技术体系、国家级示范性新药临床评价技术平台(GCP)建设、高端制剂及新型辅料研发及重大共性关键技术研究、儿童用药及关键技术研究、基于中医典籍的经典名方研发、临床急需抗体类生物类似药临床研究、联合疫苗(多联多价)的研究与开发等20项。比如，国家级示范性新药临床评价技术平台(GCP)建设的研究目标，是建成10家以上示范性GCP平台，2~4家以上机构具备开展0期临床能力，培养专业人才队伍。每个GCP平台每年牵头5项以上国家1类新药1期临床试验，重大疾病药物评价中心每年牵头10项以上2~3期临床试验，每年完成2项以上新药临床相关的新技术新方法研究，以推动我国药物临床评价达到国际水平。”十三五“预期的标志性成果是，重大品种研发成效显著，药物研发创新体系逐步完善，中药现代化进程加速，国际化步伐加快，推动医药产业快速发展。
“我们的愿景是，到2020年‘十三五’收官之年，我国医药产业创新能力显著提升，产品质量全面提高，供应保障体系更加完善，国际化步伐明显加快，医药工业整体素质大幅提升。”桑国卫表示。
为此，桑国卫建议，推进以企业为主体的医药创新体系建设：鼓励企业开展国际合作，积极引进国外先进技术，鼓励企业联合进行新药研发，加强政府在产学研联盟建设中的引领作用，完善医药创新人才激励机制，建设国际互认的研发平台。此外，完善新药研发过程相关政策：完善知识产权保护制度，鼓励医药创新；完善新药审评制度，加快新药注册；缩短医保目录遴选周期，探索动态调整机制；完善相关扶持政策，鼓励新药、医疗器械创新；完善税收和金融优惠政策。